El Ssgto. Ávalos Vargas, apodado "Sapo" o "Satanás", tenía 21 años de edad. Mandaba la segunda patrulla de la unidad de comandos del batallón Atlacatl. Otros dos miembros de su patrulla fueron acusados de los asesinatos. Recibió un curso de manejo de pequeñas unidades en Estados Unidos, entre el 30 de septiembre y el 14 de diciembre de 1988.
Fue acusado de asesinato, actos de terrorismo y actos preparatorios de terrorismo. En su confesión a la Comisión de Investigación de Hechos Delictivos (CIHD) admitió haber dado muerte a dos de los sacerdotes (los padres Amando López y Juan Ramón Moreno). Mientras se retiraba de la residencia, escuchó unos quejidos en el interior de una habitación y le dijo al soldado Sierra Ascencio que mirara. Al ver que se trataba de dos mujeres malheridas y tendidas en el suelo abrazadas, le dio la orden que les disparara, cosa que el soldado hizo. Ante el juez, igual que los demás, no ratificó su declaración extrajudicial.
Aunque el jurado escuchó la lectura de ésta, fue absuelto de todos los cargos.